Gunnar Merkert studierte Orchestermusik mit Hauptfach Fagott an der Musikhochschule Mannheim. Ab 1991 lehrte er an den Musikschulen Reutlingen, Bad Urach und Denkendorf. Aktuell ist er als Musikschullehrer für Klarinette und Saxophon und Leiter mehrerer Bläserklassen und Ensembles an der Musikschule Neckartailfingen, Bad Urach und Metzingen tätig. Bei uns leitet er die Aktive Kapelle sowie die Jugendkapelle.
1995 absolvierte Gunnar Merkert den C3-Lehrgang (Leitung von Blasorchestern) und anschließend den B-Lehrgang (Leitung von Blasorchestern und Ausbildung von Jungbläsern) an der Bundesakademie für musikalische Jugendbildung in Trossingen. Privaten Dirigierunterricht hatte er bei Miguel Angel Monroy und er nahm an einer Vielzahl von Fortbildungen namhafter Dirigenten und Komponisten teil. Von 2015 bis 2017 absolvierte er ein Privatstudium bei Prof. Albrecht Holder (Hochschule für Musik Würzburg). Seit seiner Ausbildung zum Dirigenten im Jahr 1995 leitete er in verschiedenen Musikvereinen Stamm- und Jugendblasorchester. Seit 2004 ist Gunnar Merkert Juror und Dozent für Wertungsspiele und D-Lehrgänge beim Blasmusikverband Baden-Württemberg und seit 2015 ebenfalls Kreisverbandsdirigent des Blasmusikkreisverbands Göppingen. Weiterhin spielt er im Duo „La vers de bois“, im Trio „Flagottavier“ und in der Vergangenheit viele Jahre im Sinfonischen Blasorchester Ulm.